Top các trường Đại học tại Cộng Hòa Séc dựa trên những yếu tố chính như: Mức độ hài lòng của sinh viên với chương trình học, chất lượng giảng dạy, tỉ lệ có việc làm sau tốt nghiệp, kết quả học tập của sinh viên, các nghiên cứu khoa học nổi bật của trường, cơ sở vật chất,…
1 Charles University in Prague
Thành lập năm 1348, Đại học Charles ở Prague, Cộng hòa Séc, là một trong những ngôi trường cổ kính nhất châu Âu và luôn đạt thứ hạng cao trong những bảng xếp hạng thế giới. Đại học Charles có 50.000 sinh viên, trong đó khoảng 9.000 là sinh viên quốc tế. Trường cung cấp hàng loạt các chương trình đại học và cao học giảng dạy bằng tiếng Anh như Y Dược, Nghệ thuật, Luật và Nhân văn. Trường là đối tác với nhiều trường đại học và tổ chức hàng đầu thế giới, trong đó có Hiệp hội Quốc tế các trường Đại học và Hiệp hội châu Âu vì Giáo dục Quốc tế. Có nhiều loại học bổng và trợ cấp tài chính dành cho sinh viên quốc tế tại trường.
2 University of Economics, Prague
Đại học Kinh tế, Prague (VŠE) là trường đại học công lập lớn nhất của Cộng hòa Séc. VŠE có sáu khoa cung cấp cho sinh viên một phạm vi rộng các lĩnh vực nghiên cứu và các ngành trong các chương trình cử nhân, thạc sĩ và tiến sĩ. Các nghiên cứu tại VŠE đáp ứng các yêu cầu của Hệ thống Chuyển tiền và tích lũy Châu Âu (ECTS). Hiện nay, có khoảng 17.000 sinh viên tại VŠE.
3 University of New York in Prague
Từ năm 1998, UNYP đã được cung cấp tốt nhất trong tiếng Anh-ngôn ngữ giáo dục đại học ở Trung Âu, với một tập trung vào Quản trị Kinh doanh, Truyền thông, Tài chính, CNTT Quản lý, Marketing, Quan hệ kinh tế quốc tế, Anh ngữ & Văn học và Tâm lý học. UNYP là tổ chức giáo dục Anh ngữ cao lớn nhất và hàng đầu tại Cộng hòa Séc.
4 VSB – Technical University of Ostrava
Đại học Công nghệ Ostrava (The Technical University of Ostrava – VSB) là trường Đại học đặt tại Cộng hòa Czech. Trường cung cấp các khóa Kỹ thuật và Khoa học Kinh tế bậc Cử nhân, Thạc sĩ, Tiến sĩ, với chương trình giảng dạy được cập nhật theo tiêu chuẩn mới nhất. Trường Đại học Kỹ thuật Ostrava có liên kết quốc tế với nhiều trường đại học khắp sáu lục địa trên toàn cầu.